活细胞显微技术特别是是荧光成像，对于现代细胞生物学研究的重要性是不容忽视的。活细胞荧光成像使得长期观察特定生物分子的动态和互作成为可能。过去几十年大量的技术创新推动了活细胞成像的实用化，包括开发作为基因表达和特定标记的荧光蛋白。活细胞成像一般搭载倒置显微镜进行，以便更好地容纳充满介质的培养/成像容器。

Ti2-E电动倒置显微镜是推荐的活细胞成像用镜座。该款显微镜可与在此详述的所有共聚焦和超分辨率选件组合使用。完美对焦系统4（PFS4）是业界领先的基于硬件的焦点锁定技术，实现了无焦点漂移且兼容玻璃和塑料培养容器的长期活细胞成像。还可以为水浸物镜配置自动补水装置。

Ti2-LAPP模块化照明系统使得一台显微镜可以组合多达五种不同的照明模块，可提供针对TIRF、宽场落射荧光和光刺激的选件，包括FRAP装置和数字微镜装置（DMD）。通过在一个镜座上配置多个TIRF照明器模块，可以同时进行多通道TIRF成像，且每条激光线都具有最佳TIRF角度。

BioPipeline LIVE高内涵成像系统专门配置在Ti2-E上。该系统包含一个与细胞培养箱直接连接的显微镜培养围舱，并配备最多可实现44个不同容器自动高内涵成像的样本交换机械臂。
AX / AX R共聚焦显微镜是尼康的点扫描共聚焦解决方案。其中AX R包含支持512×512像素下30帧/秒（FPS）视频成像速率的快速共振扫描系统。Denoise.ai软件模块也支持该系统，其能自动消除共振扫描共聚焦图像中的主要噪点来源——散粒噪点。

横河电机CSU系列转盘式共聚焦系统是常见的活细胞成像解决方案。CSU-X1以其光路效率高和转盘转速快而成为CSU系列中的最佳型号。CSU-W1因针孔间距宽而更适于较厚模型系统（如类器官）的成像，因为宽孔间距能减少相邻针孔之间的信号串扰，从而在分散样本中达到更深的成像深度。

超分辨率显微术使得活细胞成像应用进一步精细化和实用化。N-SIM S超分辨率结构化照明显微镜系统利用快速Gustafsson式超分辨率结构化照明将传统宽场的光学分辨率提高了一倍，且仍可达到15 FPS的成像速率。2D-SIM、3D-SIM和TIRF-SIM模式均可提供。横河电机CSU-W1 SoRa是一种转盘式共聚焦设备，其所集成的发射微透镜盘通过光学像素再分配实现超分辨率成像。